1. Contact
Contact : birsu.guzel(AT)u-pec.fr
Adresse professionnelle : Maison des Sciences de l’Environnement, 3ᵉ étage, bureau 312, Université Paris-Est Créteil, 61 avenue du Général de Gaulle, 94010 Créteil Cedex, France
Tél. professionnel :
Profil Linked In
Profil ORCID
iDHAL et CV sur HAL
2. Thèmes de recherche
- Analyse des données métagénomiques Shotgun : Développement d’un pipeline bioinformatique pour l’identification des virus et des bactéries pathogènes.
- Analyse statistique : Comparaison de l’efficacité des différents traitements tertiaires et quaternaires.
- Proposition d’une stratégie d’échantillonnage : Acquisition des données sur les virus et les bactéries pathogènes dans les filières de traitement des eaux usées du SIAAP.
3. Recherches en cours
Thèse en cours dans le cadre du programme de recherche MOCOPEE, en partenariat avec SIAAP : « Évaluation de l’efficacité du traitement tertiaire et quaternaire des rejets en station d’épuration des eaux usées (STEP) sur les virus et les bactéries pathogènes ».
• Directeur de thèse : Régis Moilleron
• Encadrants de thèse : My Dung Jusselme, Julien Le Roux
Cette thèse étudie l’efficacité des traitements tertiaires et quaternaires des stations d’épuration sur les virus et les bactéries pathogènes à l’aide d’approches bioinformatiques. L’analyse métagénomique Shotgun permettra de caractériser les communautés microbiennes avant et après traitement dans différentes stations du SIAAP. Un pipeline bioinformatique sera développé pour analyser les séquences obtenues, et une analyse statistique évaluera l’efficacité des différents traitements sur les virus et les bactéries pathogènes.
4. Enseignement actuel
Aucune responsabilité pédagogique actuellement.
5. Responsabilités collectives
Aucune responsabilité collective actuellement.
6. Parcours académique et professionnel
Période | Poste |
---|---|
Janvier 2025 - | Doctorante au Leesu - Directeur de thèse : Régis Moilleron - Encadrants de thèse : My Dung Jusselme, Julien Le Roux |
Février 2024 - Juillet 2024 | Stage de Master II : Institut Pasteur, Hub de Bioinformatique et Biostatistique & Laboratoire d’Immunologie Translationnelle, Paris - Sujet : « Analyse des données transcriptomiques, cellulaires et protéomiques dans le cadre du projet Milieu Intérieur et application des méthodes de réduction de dimension, notamment la méthode RGCCA » (Tenenhaus et al., 2014) - Encadrant : Violaine Saint-André |
2022 - 2024 | Master de Bioinformatique et Modélisation à Sorbonne Université, Paris |
2019 - 2022 | Licence de biologie avec spécialisation en bioinformatique à Sorbonne Université, Paris |