Laboratoire Eau Environnement et Systèmes Urbains (Leesu)

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933.
titre
arcMS: transformation of multi-dimensional high-resolution mass spectrometry data to columnar format for compact storage and fast access
auteur
Julien Le Roux, Julien Sade
article
, 2024, 4 (1), ⟨10.1093/bioadv/vbae160⟩
titre
Litter in French urban areas—part 1: composition, sources, and spatio-temporal variations on urban surfaces
auteur
Lauriane Ledieu, Romain Tramoy, David Mabilais, Sophie Ricordel, Zoé Bridant, Eric Bouchet, Clémence Bruttin, Bruno Tassin, Johnny Gasperi
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, 2024, ⟨10.1007/s11356-024-35203-8⟩
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Unraveling Lake Geneva's hypoxia crisis in the Anthropocene
auteur
Laura M V Soares, Olivia Desgué‐itier, Cécilia Barouillet, Céline Casenave, Isabelle Domaizon, Victor Frossard, Nelson G Hairston, Andrea Lami, Bruno J Lemaire, Georges‐marie Saulnier, Frédéric Soulignac, Brigitte Vinçon‐leite, Jean‐philippe Jenny
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, 2024, ⟨10.1002/lol2.10435⟩
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Quantification Approaches in Non-Target LC/ESI/HRMS Analysis: An Interlaboratory Comparison
auteur
Louise Malm, Jaanus Liigand, Reza Aalizadeh, Nikiforos Alygizakis, Kelsey Ng, Emil Egede Fro̷kjær, Mulatu Yohannes Nanusha, Martin Hansen, Merle Plassmann, Stefan Bieber, Thomas Letzel, Lydia Balest, Pier Paolo Abis, Michele Mazzetti, Barbara Kasprzyk-Hordern, Nicola Ceolotto, Sangeeta Kumari, Stephan Hann, Sven Kochmann, Teresa Steininger-Mairinger, Coralie Soulier, Giuseppe Mascolo, Sapia Murgolo, Manuel Garcia-Vara, Miren López de Alda, Juliane Hollender, Katarzyna Arturi, Gianluca Coppola, Massimo Peruzzo, Hanna Joerss, Carla van der Neut-Marchand, Eelco N Pieke, Pablo Gago-Ferrero, Ruben Gil-Solsona, Viktória Licul-Kucera, Claudio Roscioli, Sara Valsecchi, Austeja Luckute, Jan H Christensen, Selina Tisler, Dennis Vughs, Nienke Meekel, Begoña Talavera Andújar, Dagny Aurich, Emma L Schymanski, Gianfranco Frigerio, André Macherius, Uwe Kunkel, Tobias Bader, Pawel Rostkowski, Hans Gundersen, Belinda Valdecanas, W Clay Davis, Bastian Schulze, Sarit Kaserzon, Martijn Pijnappels, Mar Esperanza, Aurélie Fildier, Emmanuelle Vulliet, Laure Wiest, Adrian Covaci, Alicia Macan Schönleben, Lidia Belova, Alberto Celma, Lubertus Bijlsma, Emilie Caupos, Emmanuelle Mebold, Julien Le Roux, Eugenie Troia, Eva de Rijke, Rick Helmus, Gaëla Leroy, Niels Haelewyck, David Chrastina, Milan Verwoert, Nikolaos S Thomaidis, Anneli Kruve
article
, 2024, 96, pp.16215 - 16226. ⟨10.1021/acs.analchem.4c02902⟩
titre
Microplastic assessment in remote and high mountain lakes of Gilgit Baltistan, Pakistan
auteur
Maryem Mehboob, Rachid Dris, Bruno Tassin, Johnny Gasperi, Muhammad Usman Khan, Riffat Malik
article
, 2024, 365, pp.143283. ⟨10.1016/j.chemosphere.2024.143283⟩

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Micropolluants organiques

par Emilie Caupos - publié le , mis à jour le

Différentes familles de micropolluants organiques (HAP, PCB, PBDE, perturbateurs endocriniens, ...) sont analysés au laboratoire à des concentrations de l’ordre de traces et dans des matrices environnementales (liquides et solides). Des étapes de prétraitement sont alors nécessaires avant l’analyse en elle-même.

Liste des molécules analysées par UPLC-MS/MS
FamilleSous-catégorieMolécules
Biocides isothiazolinones MIT, CMIT, BIT, OIT, DCOIT
carbamates carbendazime, butylcarbamate d’iodopropynyle (IPBC)
phénylurées diuron, isoproturon
benzoylurées diflubenzuron, hexaflumuron
triazines terbuthylazine, terbutryne, cybutryne
ammoniums quaternaires 5 benzalkoniums : ADBAC C12-18 ; alkyl : DDAC
azoles tébuconazole, thiabendazole
phénoxy-acide mécoprop
pyréthrinoïdes perméthrine, deltaméthrine, cyperméthrine, bifenthrine
néonicotinoïdes acétamipride
triazole propiconazole
phénylpyrazole fipronil
Alkylphénols 4-nonylphenol (4-NP), octylphenol (OP), acide nonylphenoxyacétique (4 NP1EC)
alkylphénols-éthoxylates 4-nonylphenol-1-ethoxylate (4-NP1EO), 4- nonylphenol-2-ethoxylate (4-NP2EO), octylphenol-1-ethoxylate (OP1EO), octylphenol-2-ethoxylate (OP2EO)
Parabènes methyl-, ethyl-, butyl-, propyl-, benzyl- et isobutyl- parabène
Composés pharmaceutiques antibiotiques clarithromycine
antalgiques/anesthésiques/anti-inflammatoires paracétamol, lidocaïne, diclofénac, tramadol
bêtabloquants aténolol
antiépileptique carbamazépine
neuroleptique amisulpride
antihypertenseur irbesartan
diurétique furosémide
Liste des molécules analysés par GC-MS et GC-MS/MS
FamilleSous-catégorieAbréviationMolécule
(HAP) Naphtalene
Acenaphtylene
Acenaphtene
Fluorene
Phenanthrene
Anthracene
Fluoranthene
Pyrene
Benzo(a)anthracene
Chrysene
Benzo(b)fluoranthene
Benzo(k)fluoranthene
Benzo(a)pyrene
Indeno(123)pyrene
Dibenzo(ah)anthracene
Benzo(ghi)perylene
Polychlorobiphényles (PCB) PCB18
PCB20
PCB28
PCB31
PCB44
PCB52
PCB101
PCB105
PCB118
PCB138
PCB149
PCB153
PCB170
PCB180
PCB194
2,2’,5-Trichlorobiphenyl
2,3,3’-Trichlorobiphenyl
2,4,4’-Trichlorobiphenyl
2,4’,5-Trichlorobiphenyl
2,2’,3,5’-Tetrachlorobiphenyl
2,2’,5,5’-Tetrachlorobiphenyl
2,2’,4,5,5’-Pentachlorobiphenyl
2,3,3’,4,4’-Pentachlorobiphenyl
2,3’,4,4’,5-Pentachlorobiphenyl
2,2’,3,4,4’,5’-Hexachlorobiphenyl
2,2’,3,4’,5’,6-Hexachlorobiphenyl
2,2’,4,4’,5,5’-Hexachlorobiphenyl
2,2’,3,3’,4,4’,5-Heptachlorobiphenyl
2,2’,3,4,4’,5,5’-Heptachlorobiphenyl
2,2’,3,3’,4,4’,5,5’-Octachlorobiphenyl
Polybromodiphényléthers (PBDE) PBDE28
PBDE47
PBDE100
PBDE99
PBDE154
PBDE153
PBDE183
PBDE205
PBDE209
Phtalates (PAE) DMP
DEP
DiBP
DBP
DMEP
DMPP
DEEP
DPP
DNHP
BBP
DBEP
DCHP
DEHP
DNOP
DNP
phtalate de diméthyle
phtalate de diéthyle
phtalate de diisobutyle
phtalate de dibutyle
phtalate de bis(2-méthoxyéthyle)
phtalate de dimethylpropyle
phtalate de bis(2-ethylhexyle)
phtalate de dipentyle
phtalate de di-n-hexyle
phtalate de benzylbutyle
phtalate de bis(2-butoxyéthyle)
phtalate de dicyclohexyle
phtalate de diethylhexyle
phtalate de di-n-octyle
phtalate de dinonyle
Sous-produits de désinfection halogénés Trihalométhanes (THMs) TCM Chloroforme (trichlorométhane)
DCBM Dichlorobromométhane
DBCM Dibromochlorométhane
TBM Bromoforme (Tribromométhane)
Haloacétonitriles (HANs) DCAN Trichloroacétonitrile
TCAN Trichloroacétonitrile
BCAN Bromochloroacétonitrile
DBAN Dibromoacétonitrile
Halocétone (HK) 1,1-DCP 1,1-dichloropropanone
Halonitrométhane TCNM Trichloronitrométhane (chloropicrine)
Nitrosamines NDMA N-Nitroso-diméthylamine
NDEA N-Nitroso-diéthylamine
NDPA N-Nitroso-di-n-propylamine
NDBA N-Nitroso-di-n-butylamine
NDPhA N-Nitroso-diphénylamine
NMEA N-Nitrosométhyléthylamine
NPIP N-Nitrosopipéridine
NPYR N-Nitrosopyrrolidine
NMOR 4-Nitrosomorpholine

Equipements analytiques

La plateforme analytique du LEESU est dotée d’instruments de préparation d’échantillons (liquides et solides) et d’analyse haute précision pour les contaminants à l’état de traces (techniques chromatographiques) :

  • Préparation d’échantillons  :
     Extraction sur phase solide : Autotrace (Dionex)
    Extraction sur phase solide

Cet appareil permet la réalisation de 6 extractions sur cartouches SPE (Solid Phase Extraction) en simultané, de manière complètement automatisée et répétable. Des échantillons de différents types d’eaux (usées, pluviales, de ruissellement , de surface, ...) préalablement filtrés sont ainsi concentrés et purifiés en vue de l’analyse des micropolluants organiques.
Les méthodes d’extraction se décomposent en quatre étapes essentielles : le conditionnement, le chargement de l’échantillon, le rinçage de la cartouche, l’élution des contaminants étudiés. Les volumes et solvants utilisés sont fonction de la nature de l’échantillon, de celle des composés et de leur concentration.

 Extraction micro-ondes : Multiwave 3000 (Anton Paar)

Extraction micro-ondes

Le Multiwave est aussi un outil d’extraction automatique. Il permet la réalisation de plusieurs extractions (jusqu’à 16) d’échantillons solides (sédiments, sols, particules, ...). Un mélange de solvant est ainsi ajouté à l’échantillon solide. Celui-ci va alors pénétrer dans le solide et extraire les composés à analyser. Cette extraction est d’autant plus efficace sous micro-ondes car conduite en conditions de température et pression élevées.
De la même manière que précédemment, les solvants choisis, leurs volumes et la masse d’échantillon dépendent de la nature de l’échantillon, de celle des composés étudiés et de leur concentration.

 Enceinte d’extraction, purification, concentration : Visiprep (Sigma)

L’enceinte d’extraction Visiprep permet l’extraction simultanée de 12 cartouches SPE sous vide. Cependant les extractions sont réalisées manuellement.
Ce système peut être connecté à une arrivée d’azote. Cela permet d’évaporer les échantillons sous flux d’azote.

Une fois les échantillons filtrés, purifiés, concentrés et transférés dans le solvant organique, ceux-ci sont analysés. Selon les familles de polluants étudiées (et notamment selon leurs caractéristiques physico-chimiques), différents équipements peuvent être utilisés. Il s’agit notamment de techniques de chromatographie couplées à des détecteurs spécifiques ou universels ou de différentes sensibilités.
La plateforme analytique du LEESU comprend ainsi des équipements de chromatographie en phase gazeuse et en phase liquide

  • Analyse par chromatographie en phase gazeuse

La chromatographie en phase gazeuse permet la séparation et l’analyse de composés volatils ou semi-volatils, de différente polarité. Elle peut être couplée à des détecteurs peu sensibles de type catharomètre, à ionisation de flamme, ..., spécifiques (comme le détecteur à capture d’électron..) ou à des détecteurs très sensibles comme le spectromètre de masse (MS, MSn, quadrupôle, piège ionique, temps de vol, ...). Le LEESU est ainsi doté d’un GC-MS Focus-DSQ (Thermo) et d’un GC-FID Trace Ultra (Thermo). Ce dernier a été additionné d’un détecteur triple quadrupôle Thermo Quantum Ultra permettant d’effectuer des analyses par GC-MS-MS.

Parc GC-MS

 GC-MS : Focus-DSQ (Thermo)

De nombreuses méthodes d’analyse de traces de micropolluants organiques ont été développées en GC-MS (HAP, PCB, PBDE, alkylphénols, ...). Ces méthodes de quantification sont basées l’analyse en mode SIM, sélectionnant un composé par des pics caractéristiques de son spectre de masse. Toutes ces méthodes multicomposés ont été développées et validées, notamment à l’aide d’échantillons certifiés. Des optimisations sont toutefois nécessaires dans le cas de changement de matrices ou de méthodes de purification.

 GC-MS/MS : Trace-Quantum ultra (Thermo)

L’acquisition de spectres en mode SRM (MS-MS) permet d’effectuer des analyses de traces de composés organiques beaucoup plus sensibles qu’en mode SIM. Cela permet en effet de s’affranchir des interférences sortant aux temps de rétention de nos composés d’intérêt ainsi que d’améliorer le rapport signal/bruit et de ce fait, diminuer les limites de détection.
Des analyses sont en cours de développement et de validation pour les HAP, PCB, PBDE. De plus, notre appareil étant équipé d’un passeur d’échantillons Triplus, des analyses par microextraction sur phase solide (SPME) sont développées pour les HAP.

 GC-FID : Trace Ultra (Thermo)

La détection par ionisation de flamme permet l’analyse de tout composé volatil ou semi-volatil. Cependant, les limites de détection sont bien plus élevées qu’en spectrométrie de masse. Les analyses de traces sont donc impossibles à l’aide de cet équipement.
Le GC-FID a été notamment utilisé pour le développement des analyses par SPME. Des développements sont prévus pour l’analyse d’hydrocarbures aliphatiques.

  • Analyse par chromatographie en phase liquide

La chromatographie en phase liquide permet la séparation et l’analyse de composés peu voire non volatils, de polarités différentes. Elle est généralement couplée à des détecteurs universels utilisant la spectrophotométrie (UV, DAD, ..), spécifiques (de fluorescence, NT, ..) ou à des détecteurs très sensibles comme le spectromètre de masse (MS, MSn, quadrupôle, piège ionique, Orbitrap, temps de vol, ...). Le LEESU est ainsi doté d’une chromatographie ionique Dionex 3000 (Thermo) et d’une UPLC-MS-MS Acquity UPLC-TQD (Waters).

 UPLC-MS/MS : Acquity UPLC-TQD (Waters)

UPLC-MS-MS

 HPLC-UV : Dionex 3000 (Thermo)