Laboratoire Eau Environnement et Systèmes Urbains (Leesu)

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titre
arcMS: transformation of multi-dimensional high-resolution mass spectrometry data to columnar format for compact storage and fast access
auteur
Julien Le Roux, Julien Sade
article
, 2024, 4 (1), ⟨10.1093/bioadv/vbae160⟩
titre
Litter in French urban areas—part 1: composition, sources, and spatio-temporal variations on urban surfaces
auteur
Lauriane Ledieu, Romain Tramoy, David Mabilais, Sophie Ricordel, Zoé Bridant, Eric Bouchet, Clémence Bruttin, Bruno Tassin, Johnny Gasperi
article
, 2024, ⟨10.1007/s11356-024-35203-8⟩
titre
Unraveling Lake Geneva's hypoxia crisis in the Anthropocene
auteur
Laura M V Soares, Olivia Desgué‐itier, Cécilia Barouillet, Céline Casenave, Isabelle Domaizon, Victor Frossard, Nelson G Hairston, Andrea Lami, Bruno J Lemaire, Georges‐marie Saulnier, Frédéric Soulignac, Brigitte Vinçon‐leite, Jean‐philippe Jenny
article
, 2024, ⟨10.1002/lol2.10435⟩
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Quantification Approaches in Non-Target LC/ESI/HRMS Analysis: An Interlaboratory Comparison
auteur
Louise Malm, Jaanus Liigand, Reza Aalizadeh, Nikiforos Alygizakis, Kelsey Ng, Emil Egede Fro̷kjær, Mulatu Yohannes Nanusha, Martin Hansen, Merle Plassmann, Stefan Bieber, Thomas Letzel, Lydia Balest, Pier Paolo Abis, Michele Mazzetti, Barbara Kasprzyk-Hordern, Nicola Ceolotto, Sangeeta Kumari, Stephan Hann, Sven Kochmann, Teresa Steininger-Mairinger, Coralie Soulier, Giuseppe Mascolo, Sapia Murgolo, Manuel Garcia-Vara, Miren López de Alda, Juliane Hollender, Katarzyna Arturi, Gianluca Coppola, Massimo Peruzzo, Hanna Joerss, Carla van der Neut-Marchand, Eelco N Pieke, Pablo Gago-Ferrero, Ruben Gil-Solsona, Viktória Licul-Kucera, Claudio Roscioli, Sara Valsecchi, Austeja Luckute, Jan H Christensen, Selina Tisler, Dennis Vughs, Nienke Meekel, Begoña Talavera Andújar, Dagny Aurich, Emma L Schymanski, Gianfranco Frigerio, André Macherius, Uwe Kunkel, Tobias Bader, Pawel Rostkowski, Hans Gundersen, Belinda Valdecanas, W Clay Davis, Bastian Schulze, Sarit Kaserzon, Martijn Pijnappels, Mar Esperanza, Aurélie Fildier, Emmanuelle Vulliet, Laure Wiest, Adrian Covaci, Alicia Macan Schönleben, Lidia Belova, Alberto Celma, Lubertus Bijlsma, Emilie Caupos, Emmanuelle Mebold, Julien Le Roux, Eugenie Troia, Eva de Rijke, Rick Helmus, Gaëla Leroy, Niels Haelewyck, David Chrastina, Milan Verwoert, Nikolaos S Thomaidis, Anneli Kruve
article
, 2024, 96, pp.16215 - 16226. ⟨10.1021/acs.analchem.4c02902⟩
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Microplastic assessment in remote and high mountain lakes of Gilgit Baltistan, Pakistan
auteur
Maryem Mehboob, Rachid Dris, Bruno Tassin, Johnny Gasperi, Muhammad Usman Khan, Riffat Malik
article
, 2024, 365, pp.143283. ⟨10.1016/j.chemosphere.2024.143283⟩

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Séminaire : Philippe Dubois et Yi Hong
le 5 mars 2019

par Administrateur - publié le

Le prochain séminaire du LEESU aura lieu le mardi 5 mars 2019 à l’ENPC à 11h30, dans la salle P314.

Il sera constitué d’une intervention de Philippe Dubois et Yi Hong,

Intervention de Philippe Dubois :
Apport des bases de données relationnelles dans la gestion de mesures

 Introduction aux bases de données (au sens technologie de l’information).
 Avantages de l’utilisation d’une base de données comparé au travail unique sur fichier.
 Apports et potentiel d’utilisation des bases.
 Exemple du développement de la base de données ‘Data’ au LEESU dédiée au stockage et à la formalisation de données issues de mesures en continues ou ponctuelles :
- Automatisation du stockage de données issues de mesures en continu (à partir de fichiers classiques déposés manuellement ou bien de données télétransmises).
- les diverses possibilités d’accès aux données et notamment :
- directe depuis votre outils préféré de développement (Matlab, R , Python,..Excel)
- à partir d’une application ‘maison’ et ‘générique’ d’affichage graphique et d’export.
- à partir d’interfaces du marché ou d’interface spécifique ’en ligne’.
 Traçabilité : le lien entre base ‘Data’ et ‘matériel’.

Intervention de Yi Hong :
Développement et applications scientifiques basés sur des bases de données relationnelles

 Utilisation directe de la base « data » au leesu
• Lecture et téléchargement de données ;
• Traitement de données (nettoyage, plot, etc.), et écriture dans la base ;

 Développement et applications avancées des bases de données
• Utiliser l’API
En informatique, une interface de programmation applicative (souvent désignée par le terme API pour application programming interface) est un ensemble normalisé de classes, de méthodes ou de fonctions qui sert de façade par laquelle un logiciel offre des services à d’autres logiciels (wikipekia).
Il permet (i) de communiquer facilement avec la base de données (SQL), (ii) de simplifier l’accès à la basse de données pour une analyse approfondie (avec Matlab, R ou Python sans écrire les requêtes SQL) ; (iii) de transférer de la base de données au site internet les données.

• Le framework Django
Django est un cadre de développement web open source en Python, il a pour but de rendre le développement web simple et rapide. (par exemple, Instagram, Nextdoor, etc.)
Il est composé de trois parties distinctes :
1, Un langage de gabarits flexible qui permet de générer du HTML, XML ou tout autre format texte ;
2, Un contrôleur fourni sous la forme d’un « remapping » d’URL à base d’expressions rationnelles ;
3, Une API d’accès aux données est automatiquement générée par le cadre compatible CRUD. Inutile d’écrire des requêtes SQL associées à des formulaires, elles sont générées automatiquement par l’ORM.

 Le site Balneau (https://balneau-leesu-rec.enpc.fr/)
• Le site est alimenté par la base de donnée « Barral », la structure est dans le cadre du Django ;
• Extraction de données météo sur internet et les écrire sur les bases « Barral » et « data-leesu » ;
• Lecture des données brutes (température, Chl-a, Phycocyaninn, etc.) depuis la base « data » ; nettoyage de données et les écrire sur les bases « Barral » et « data-leesu » ;
• Configuration automatique de modèle 3D avec les données de bases ;
• Simulations, écriture des données simulées sur la base « Barral » ;
• L’affichage de données sur le site internet.