Laboratoire Eau Environnement et Systèmes Urbains (Leesu)

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933.
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arcMS: transformation of multi-dimensional high-resolution mass spectrometry data to columnar format for compact storage and fast access
auteur
Julien Le Roux, Julien Sade
article
, 2024, 4 (1), ⟨10.1093/bioadv/vbae160⟩
titre
Litter in French urban areas—part 1: composition, sources, and spatio-temporal variations on urban surfaces
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Lauriane Ledieu, Romain Tramoy, David Mabilais, Sophie Ricordel, Zoé Bridant, Eric Bouchet, Clémence Bruttin, Bruno Tassin, Johnny Gasperi
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, 2024, ⟨10.1007/s11356-024-35203-8⟩
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Unraveling Lake Geneva's hypoxia crisis in the Anthropocene
auteur
Laura M V Soares, Olivia Desgué‐itier, Cécilia Barouillet, Céline Casenave, Isabelle Domaizon, Victor Frossard, Nelson G Hairston, Andrea Lami, Bruno J Lemaire, Georges‐marie Saulnier, Frédéric Soulignac, Brigitte Vinçon‐leite, Jean‐philippe Jenny
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, 2024, ⟨10.1002/lol2.10435⟩
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Quantification Approaches in Non-Target LC/ESI/HRMS Analysis: An Interlaboratory Comparison
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Louise Malm, Jaanus Liigand, Reza Aalizadeh, Nikiforos Alygizakis, Kelsey Ng, Emil Egede Fro̷kjær, Mulatu Yohannes Nanusha, Martin Hansen, Merle Plassmann, Stefan Bieber, Thomas Letzel, Lydia Balest, Pier Paolo Abis, Michele Mazzetti, Barbara Kasprzyk-Hordern, Nicola Ceolotto, Sangeeta Kumari, Stephan Hann, Sven Kochmann, Teresa Steininger-Mairinger, Coralie Soulier, Giuseppe Mascolo, Sapia Murgolo, Manuel Garcia-Vara, Miren López de Alda, Juliane Hollender, Katarzyna Arturi, Gianluca Coppola, Massimo Peruzzo, Hanna Joerss, Carla van der Neut-Marchand, Eelco N Pieke, Pablo Gago-Ferrero, Ruben Gil-Solsona, Viktória Licul-Kucera, Claudio Roscioli, Sara Valsecchi, Austeja Luckute, Jan H Christensen, Selina Tisler, Dennis Vughs, Nienke Meekel, Begoña Talavera Andújar, Dagny Aurich, Emma L Schymanski, Gianfranco Frigerio, André Macherius, Uwe Kunkel, Tobias Bader, Pawel Rostkowski, Hans Gundersen, Belinda Valdecanas, W Clay Davis, Bastian Schulze, Sarit Kaserzon, Martijn Pijnappels, Mar Esperanza, Aurélie Fildier, Emmanuelle Vulliet, Laure Wiest, Adrian Covaci, Alicia Macan Schönleben, Lidia Belova, Alberto Celma, Lubertus Bijlsma, Emilie Caupos, Emmanuelle Mebold, Julien Le Roux, Eugenie Troia, Eva de Rijke, Rick Helmus, Gaëla Leroy, Niels Haelewyck, David Chrastina, Milan Verwoert, Nikolaos S Thomaidis, Anneli Kruve
article
, 2024, 96, pp.16215 - 16226. ⟨10.1021/acs.analchem.4c02902⟩
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Microplastic assessment in remote and high mountain lakes of Gilgit Baltistan, Pakistan
auteur
Maryem Mehboob, Rachid Dris, Bruno Tassin, Johnny Gasperi, Muhammad Usman Khan, Riffat Malik
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, 2024, 365, pp.143283. ⟨10.1016/j.chemosphere.2024.143283⟩
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Offre de stage de M2 au Leesu en 2021 - Oxydation de micropolluants et analyse par spectrométrie de masse => STAGE POURVU

par Daniel Thevenot - publié le , mis à jour le

Offre de stage de M2 au Leesu en 2021 - Caractérisation par spectrométrie de masse haute résolution de produits de dégradation lors de l’oxydation de micropolluants organiques - Niveau Master 2 ou Ingénieur 3ème année (6 mois) => STAGE POURVU

Contexte scientifique du stage

De nombreux micropolluants émergents sont présents dans les eaux urbaines mais leur comportement et leurs transformations dans les stations de traitement des eaux usées et dans l’environnement sont peu connus. L’analyse de micropolluants organiques est généralement réalisée en ciblant des molécules spécifiques, mais le développement de la spectrométrie de masse haute résolution (HRMS) permet d’analyser de manière non-ciblée les échantillons et d’identifier des produits inconnus. Les méthodes actuelles pour l’analyse non-ciblée des micropolluants organiques en HRMS (de l’extraction au traitement de données) sont longues et complexes, l’identification précise de molécules inconnues requérant de multiples étapes et des vérifications poussées. Des approches plus exhaustives peuvent être développées pour caractériser et suivre les micropolluants organiques de manière globale dans les eaux urbaines. Une thèse est en cours de réalisation sur ce sujet.

Cadre et partenaires du projet

Le stage s’insère dans le cadre d’un projet de recherche WaterOmics financé par l’Agence Nationale de la Recherche (2017-2021). Ce projet s’intitule « Traquer les micropolluants organiques dans les eaux urbaines par spectrométrie de masse haute résolution : approches omiques, empreintes et indices » et comporte trois tâches de recherche :

  1. Développement analytique de protocoles d’extraction pour la caractérisation de polluants par HRMS,
  2. Développement de méthodes de traitement de données et d’indices,
  3. Application des méthodes développées aux eaux urbaines (performance du traitement des micropolluants organiques dans les eaux usées).

Le projet s’appuie sur les instruments analytiques de la plateforme d’analyse Prammics, en particulier sur les instruments de chromatographie en phase liquide (Waters Vion – UPLC-IMS-QTOF). L’UPLC-IMS-QTOF est un instrument de HRMS équipé d’une séparation par mobilité ionique (IMS) permettant de séparer des composés habituellement co-élués (ex. isomères) et d’augmenter ainsi la résolution de l’instrument.

Le projet WaterOmics est une collaboration avec le Syndicat Interdépartemental pour l’Assainissement de l’Agglomération Parisienne (SIAAP) qui fournit un accès à des stations d’épuration majeures de l’agglomération parisienne et participe au prélèvement d’échantillons.

Pilotes du projet WaterOmics : Julien Le Roux et Régis Moilleron

Objectifs du stage

Le stage s’insèrera principalement dans la tâche 2 du projet WaterOmics. Les objectifs sont les suivants :

  • Effectuer différents tests d’oxydation (UV/H2O2 et ozonation) en matrice simples (conditions contrôlées) sur des molécules pharmaceutiques
  • Développer des méthodes de caractérisation des produits de dégradation formés suite au traitement appliqué
  • Réaliser des tests de toxicité sur des extraits d’eaux réelles (matrices complexes) soumises à ces mêmes traitements
  • Poursuivre le développement d’une application pour le traitement de données issues de l’analyse en haute résolution.

Le stage comprendra plusieurs volets nécessitant des compétences diverses :

  • Préparation (extraction) et analyses d’échantillons (chromatographie liquide et spectrométrie de masse)
  • Manipulation et traitement de données : traitements statistiques, utilisation de logiciels de traitement de données (ex. R)

Profil recherché

Formation de niveau M2 ou ingénieur en chimie analytique ou chimie de l’environnement :

  • Compétences en chimie analytique (méthodes d’extraction, de fractionnement, de séparation et de détection)
  • Compétences en chimie de l’environnement (polluants, qualité des eaux, traitement des eaux et notions d’écotoxicologie)
  • Connaissances en statistiques et langages de programmation
  • Aisance dans la rédaction de rapport et bon niveau d’anglais souhaitable

Candidatures à ce stage

Pour candidater envoyer une lettre de motivation et un curriculum vitae détaillé ou pour demander plus d’informations, contacter :

Proposition de stage : fichier PDF

Déroulement du stage

Lieu de stage

Laboratoire eau, environnement, et systèmes urbains (Leesu), 61 avenue du Général de Gaulle, 94010 CRÉTEIL Cédex

Durée du stage

6 mois

Début du stage

Février-mars 2021

Date limite de candidature

15 janvier 2021